¡Saludos!,les comparto un tutorial sobre una de las formas de instanciar objetos "en el vuelo" (tiempo de ejecución) usando C# en Unity 5.
Para ahondar en el tema y ver otras formas de instanciar, pueden visitar la misma documentación del sitio oficial de Unity: http://docs.unity3d.com/es/current/Manual/InstantiatingPrefabs.html.
Bienvenidas todas las sugerencias y comentarios constructivos.